Интеграза

Интеграза (IN) — фермент, катализирующий интеграцию (включение) ДНК вируса (ретровируса, в частности, ВИЧ[1][2]) в хромосому клетки-хозяина. Перед интеграцией линейные молекулы ДНК вируса сначала замыкаются в кольцо и затем уже встраиваются.

Цинк-связывающий домен интегразы
PDB 1wjd EBI.jpg
Структура N-концевого цинк-связывающего домена интегразы вируса hiv-1
Идентификаторы
Символ Integrase Zn
Pfam PF02022
InterPro IPR003308
SCOP 1wjb
SUPERFAMILY 1wjb
Доступные структуры белков
Pfam структуры
PDB RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum 3D-модель
Ядро интегразы
PDB 1c1a EBI.jpg
Идентификаторы
Символ rve
Pfam PF00665
Pfam clan CL0219
InterPro IPR001584
SCOP 2itg
SUPERFAMILY 2itg
Доступные структуры белков
Pfam структуры
PDB RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum 3D-модель
ДНК-связывающий домен интегразы
PDB 1c1a EBI.jpg
Идентификаторы
Символ IN DBD C
Pfam PF00552
InterPro IPR001037
SCOP 1ihw
SUPERFAMILY 1ihw
Доступные структуры белков
Pfam структуры
PDB RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum 3D-модель

Ретровирусные интегразы — ключевой компонент прединтеграционного комплекса (PIC).

Сходные ферменты фагов — phage integrase, например λ phage integrase (Int).

Структура

Все ретровирусные интегразы состоят из трех канонических доменов:

  • N-концевой цинк-связывающий домен с мотивом HHCC (например, His12 His16 Cys40 Cys43 у ВИЧ-1);
  • каталитический домен (RNaseH);
  • C-концевой ДНК-связывающий домен (SH3).

Изучена структура доменов интеграз вирусов HIV-1, HIV-2, SIV, Rous Sarcoma Virus (RSV), первые результаты опубликованы в 1994 году. Имеются данные, свидетельствующие, что интеграза функционирует как тетрамер. Несколько белков клетки взаимодействуют с интегразой, в частности, человеческий хроматин-ассоциированный LEDGF.

Интеграза ВИЧ

Вирус иммунодефицита человека содержит интегразу размером 32 кДа в гене Pol. Данный фермент является перспективной целью для ВААРТ. Используется 3 препарата, являющихся ингибиторами интегразы ВИЧ: Ралтегравир (RAL, Исентресс, с 2007 года), Долутегравир (DTG, Тивикай), Элвитегравир (EVG, с 2012 года)[3]

Примечания

  1. HIV Integrase, a Brief Overview from Chemistry to Therapeutics
  2. СТРУКТУРА И ФУНКЦИИ ИНТЕГРАЗЫ ВИЧ-1 Архивная копия от 1 октября 2008 на Wayback Machine, Успехи биологической химии, т. 45, 2005, с. 87—122
  3. HIV Integrase Inhibitors: 20-Year Landmark and Challenges / Adv Pharmacol. 2013;67:75-105. ISSN 1054-3589, doi:10.1016/B978-0-12-405880-4.00003-2 PMID 23885999.

Ссылки